lørdag den 21. august 2010

släktträd för fisk

Syfte

Syftet med denna studie och motsvarande resultat är att fastställa släktskapet med ett antal fiskar och skaldjur. Detta måste göras först att få kunskap om metoden, som är elektrofores av proteiner i stället för kärnämne, men även delvis att göra lite evolutionära skäl att slutligen komma med ett släktträd.
Teori
Karta över evolution och genetik


Om man betraktar sammansättningen och mångfald av djur på jorden, från en darwinistisk synpunkt, är en uppfattning av alla djur är skapade från samma förfader, som här skulle vara en liten procaryote organismer. Denna organism borde ha multiplicerat med en hel del nya arter, som i sin tur skulle ha utvecklats till nya arter och underarter. Anledningen till att det i dag är så rik på vilt med fåglar, fiskar och andra djur mark att alla dessa personer har val trycket på annat märke från sina kamrater så att de bättre kan utnyttja en specifik nisch. Som ett exempel på detta, vi giraff, Giraffa Camelopardalis, lever främst från bladen på höga akacia, som ingen annan kan nå. Det kommer från Okapi som då har ett urval tryck att isolera sig, nisch differentiering, Okapi, så att den kan nå de höga blad, och du har tittat på vägen för en lång tid, vilket skapar två arter. Detta exempel på giraffen får inte ses som Jean Baptist Lamarc gjorde det med att man genom giraffens liv, kommer det att få längre hals, men det uppstår spontana mutationer som gör det en längre hals, och att hans barn kommer att ha bättre bärkraften som ett resultat av mer mat, vilket leder gen / fastighet med dem.

Man ser på detta från ett molekylärt perspektiv, kan man använda den för att studera deras ursprung, kan en titt på vilka proteiner som olika individer har, och då bland annat ta reda på hur gammalt protein är och vad djuren i familjen med vem. Hela denna gren av biologi, så läran om ärftlighet eller genetik är alltså studiet av levande organismer kommer deras utveckling och ärvda egenskaper genom studier av gener. Med andra ord, betydelsen av arv och variation när en organism skapas och utvecklas. Och det var i första hand uppstod när folk började bli intresserad av, från vilken de mänskliga stammar.



Analog och homologa utveckling


När de började klassificera djur på jorden, i ett försök att skapa en universell släktträd skulle man behöva veta vilka djur i familjer med vem, och hur nära familjen de var, så det såg ut på likheterna. Och du såg på likheter mellan djur från två olika kriterier: homolog, vilket är ett uttryck för att de har samma förfader, och sedan ett gemensamt arv. Så är en fastighet liknande i två djur, eftersom deras gemensamma anfader hade fastigheten. Analog är motsatsen, här ser likadan ut, inte för att de har samma grundläggande form, men eftersom den evolutionära processen har utvecklat samma egenskaper, t.ex. utveckling är också kallas konvergent utveckling. En annan nackdel med denna typ av utveckling kallas avvikande utveckling, och är ett uttryck för två djur som är homolog i samma klass (samma grundläggande form) men är annorlunda eftersom de har utvecklats i två olika riktningar.
Art protein sammansättning


Det som är spännande arter protein sammansättning är att från detta, kan se varifrån de har sitt ursprung kan man också ganska exakt datera protein ålder, för om två djur, såsom fisk, har samma protein, så det är samma protein, förstås så att de två proteinerna i princip skulle kunna uppstå från mutationer självständigt, men sannolikheten för detta är mycket nära noll. Så om du hittar samma protein i två arter, kan en med säkerhet säga att de har samma förfader, men endast på en jämförelse av proteiner, kan man inte nödvändigtvis säga något mer om när de har utvecklats bort från deras gemensamma stamfader. Till exempel har vi i försöket ingick en aktin-myosin protein lösning, och spännande med detta är att det är en av de viktigaste muskelproteiner av mänsklig muskelvävnad är uppbyggd. Har fisken även detta kan man säga mycket om protein ålder, för det är som jag sa, riktigt länge sedan att den mänskliga stamceller form och fisk, skiljde sig från varandra.

Något annat som proteiner visar naturligtvis också sammansättningen av DNA, eftersom det är DNA som i slutändan kodar för proteiner en viss cell kan producera.

Metod

se Motion Guide.

Fisk och skaldjur som vi använde för våra försök var följande:

1. Räkor (saltvatten) - räkor

2. Krabbtaska - Cancer pagurus

3. Torsk - Gadus morhua

4. Pollock - Pollachius virens

5. Sill - Glupea harengus

6. Fjärsing - Trachinidae

7. Hälleflundra - Reinhardtius hippoglossoides

8. Rödspätta - Pleuronectes platessa
Hypotes

Innan du fått tillgång till avancerad molekylärbiologi verktyg vi har i dag gjort stammen av träd från andra kriterier. Mån såg främst till utseende och livsmiljöer jag har också tänkt som en hypotes för att skapa ett släktträd utifrån dessa kriterier, senare för att se hur exakt den är jämfört med den molekylärbiologiska metoden.
Att ge en ganska realistisk träd, måste vi utforska olika levnadsvillkor för olika fisk och skaldjur. Det första vi ser är att de alla saltvattenfisk, detta är inte så betydande jämfört med muskel proteiner, men hjälper till att förstå deras ursprung. Man kan alltså tänka sig att även i gamla tider, har varit en skiljelinje mellan den fisk som lever i sötvatten, och de som levde i saltvatten.


Andra kan vi se att de alla har gälar, är detta givetvis också en egenskap som är unik för just fisk och skaldjur, en enkel iakttagelse, men det visar att de alla har samma förfader, men återigen långt bak. Men det är bara inte alla marina djur som har gälar, till exempel sköldpaddor, saltvatten krokodiler, valar och sälar.



Resultat

Nedan är en genomsökning av gel, som det såg ut efter elektrofores. Vi hade två bilder att välja på, detta var den starkaste ren färg regelbundet, och jag valde den för just detta skäl. För den andra gelen var band mycket svaga, och det var därför svårt att skilja mellan de olika enskilda banden. Jag tror att vi kan förbättra detta.

Wells innehålla följande:
1: Kalejdoskop standard 2: myosin-aktin standard 30-10: fisk (se metod för sekvens).



Du kan beställa nu bestämma ett protein som uppskattas av denna modell (Bild 5) .. Om du känner till deras vikt kan man se hur mycket den skulle ha horisontella och vice versa, kan man hitta sin vikt genom att se på migration. Detta kan vi använda för att ta reda på vilka proteiner i fisk (se liste1).

Ett protein som bara räkor och taskekrappen har sett som bandet har funnits runt 8 mm och därmed 5 kD motsvarar detta thymosin. Räkor och taskekrappen därmed både protein, som i sin tur av annan fisk har, detta ger upphov till en gemensam förfader som har utvecklats bort från fisken. Ett band att nästan all fisk och skaldjur har och som är horisontellt runt 4,6 mm Kan nebulin. Det är att de alla har ett band vid denna tidpunkt, måste talar om protein här vara mycket gamla eftersom det har funnits i olika arter nu gemensam förfader, är det protein arbetar också i samarbete med aktin, vilket jag senare kommer att visa att de alla har, så därför du har en, det var ofta den andra, annars protein (i detta fall aktin) fungerar inte optimalt om det beror på att huvudet skulle fungera. En av de första att bli upptäckt, är att de alla har ett band som har övergripande 4 mm Detta är enligt vår modell av myosin. Det är som en gammal aktin protein som förekommer i alla arter. Något annat som också är unikt i myosin-aktin som bildats i all fisk är att det är det är samma muskel proteiner, som vi människor och de flesta djur har. Detta säger oss att säga, det är en otroligt gammal protein till oss, har fåglar och fiskar gemensam förfader hade det och detta förfader är flera miljoner år sedan. Detta säger också något om proteinet status. De har varit mycket viktigt och viktigt för djuren och inte bara det, de har också uppenbarligen fungerat optimalt på lika många år, eftersom det inte hade vad som skulle en andra, mer muskler protein har ersatt den ganska snabbt, och med andra, skulle mer protein ha en bättre chans att överleva. Proteinet aktin, som också är en mycket viktig protein, finner vi ett stycke längre ned, vid ungefär 5,3 mm . Det är dock lite oklart att se hur många människor har detta protein, men ummidelbart jag skulle tro att det var mest. De två proteinerna samverkar nämligen, man kan inte fungera utan det andra och vice versa.

Om vi nu gå in och titta på vad fisk i familjer med varandra, vi sedan snabbt för torsk och Pollock är mycket lika, inte bara till utseendet, men särskilt i protein sammansättning, men även sill, många homolog band med två. Det är därför, ur detta synsätt säkert att säga att rödspätta och torsk är familj och att de har en homolog utveckling, sill, har dock utvecklats till en andra urtaget, och genom selektiva tryck och mutation, det så och säga ändrat riktning jämfört med torsk och Pollock.

Hälleflundra och rödspätta är också tydligt från proteinet krets i familjen, och därmed en homolog utveckling påminner de fortfarande varandra mycket. Däremot kan man säga att rock skivan är en äldre art, eftersom dess ögon mer som en "vanlig" fisk som har ögonen på båda sidor, medan flundra har båda ögonen på samma sida. Ingen mugg visar sig också vara familjen av de två eftersom de har mycket liknande band. Man kan dock titta på mina tidigare släktträd som jag har placerat dem i samma art grupp, men det är också tillverkat av ett rent utseende synvinkel. Inget ansikte har förändrats avsevärt sedan slits mellan den och rödspätta. Detta fenomen att en fisk inte liknar något från naturen det verkligen tillhör, utan att den snarare liknar en annan grupp kallas en polyfyletisk grupp (säger det som det ser ut som det tillhör). Räkor och taskekrappen ser mycket olika, men de har vissa homologa band, eftersom ingen av de andra. (Se opg 2).
Diskussion

Det fanns bara en verklig källa till fel, men det var också av stor betydelse. Nämligen att våra elektrofores inte fick köra tillräckligt länge. Detta innebär att banden inte skulle ha gått så långt och att det därför inte finns så mycket sprids på. Skillnaden mellan band annars hade gjort två uppgiften betydligt lättare. Det är därför svårt att avgöra vilka fiskar har proteiner. Ribbon densitet har också påverkat fastställandet av släktskap mellan fisk. Men det är också viktigt att säga här att även de två banden har gått samma längd, är det inte nödvändigtvis samma protein. För proteiner består som sagt av olika aminosyror och sammansättningen av molekyler skiljer sig åt och därmed också deras vikt. Så du kan säga mycket väl ha två olika proteiner med samma molekylvikt. Metoden att bestämma slægsskab Jag tror ummidelbart, med min begränsade kunskap om andra metoder är bra nog, om så bara experiment är välgjord.