Om du pratar om vad frekvensen av gener för ärftliga sjukdomar kan påverkas av, finns det tre punkter som de ber oss att fundera, dessa är:
· En ökad användning av embryoforskning: Detta kan göras så att föräldrarna skulle veta barnets funktionshinder och sjukdom, och använda denna kunskap kan avgöra om de vill abort.
· Ökad genetisk rådgivning: Detta tror jag skulle vara förenad med en undersökning av föräldrar, så du kan ge råd om eventuella risker vid graviditet. Om du tittar på exemplet från tidigare, där båda föräldrarna som möjligt att sjukdomen kan informera dem om att i teorin skulle vara 25% risk att få ett barn med sjukdomen, kan du också gå till ytterligheter, och "skarva" par tillsammans så att minst en av dem var homozygot dominant, så att de inte kunde få barn med sjukdomen, men som sagt, skulle detta vara en extrem.
· Bättre behandlingsmöjligheter för patienter: Det skulle naturligtvis vara att föredra, eftersom det i princip skulle kunna släppa dessa två punkter. Om detta hade varit ett botemedel / läkemedel som kan bota för olika ärftliga sjukdomar skulle det vara otroligt fördelaktigt. Den metod jag skulle se som bäst skulle vara om vi kunde gå in och reparera i genen, och odla friska gener, och sedan lägga dem i stället för de sjuka. En annan metod är att undersöka kvinnans ägg, och sedan välja ut de ägg som hade fenotypen C, så att cystisk fibros kan inte uttryckas.
lørdag den 21. august 2010
Partialtryck och pulmonell ventilation
Figur 1 (visas inte) visar lungventilation i vila, som en funktion av partialtrycket av dioxygen (O 2) i artärerna, och för att få en bra modell, har det observerats CO 2 är partialtrycket konstant vid 40 mm Hg. Som framgått av den kurva krökning (hyperbel), är med god approximation prata om en exponentiell borttagning. Detta innebär att vi är extrema på den första axeln, med en partialtrycket av cirka 70 till 100 + mm Hg, det finns lite förändring i pulmonell ventilation, som kommer att ca. 8 - 10 liter per. minuter. Men vi rör oss mer mot ursprunget, ökar lungventilation mer slående exempel, om vi har en del tryck i artärerna mellan 50 mm Hg och 30 mm Hg, det finns en ökning av lungventilation i långt över 15 (från ca. 15 till 30, vilket motsvarar en fördubbling) Anledningen till att denna kurva ser ut som den gör och att det inte är linjär, som kanske kunde ha förutsägas från en enkel hypotes, eftersom den beryktade iltbindingskurve (se sid 136, fig. 6,6, fysiologi). Kurvan för arteriellt blod, som vår figur 1 också omfattar har en karakteristisk s form. En enkel uppfattning om iltbindingskurven visar hur hemoglobin särskilda iltbinding påverkar syreupptagningsförmågan och iltafgivelsen. I lungorna utsätts för ett blodet syre. 100 mm Hg, vilket ger en syremättnad på ca. 98%, vilket motsvarar nästan en 100% mättnad. Eftersom kurvan är platt i toppen, en liten minskning syre i alveolerna inte ändra mycket på syremättnad i blodet. I aerob vävnad syre trycket kommer att vara betydligt lägre (20 - 40 mm Hg), vilket innebär att här ges syre från blod till vävnader. Lungventilation är ett uttryck för hur hårt och hur fort du andas, med andra ord:
respiratoriska djup * andningsfrekvens = lungventilation
Och det gör att en förändring, vår andningscentrum som ligger i den utvidgade delen av ryggmärgen, förlängda märgen . Men för att förändra vår Ventilation måste ske tämligen omfattande ändringar ip (O 2). För när vi vet att trycket av CO 2 var konstant, förändringar i pH inte stor, men så vi kan se igen från kurvans form som också måste vara en ganska stor förändring så att ventilationen ökar.
Figur 2 (visas inte) visar samma som figur 1 men istället för att ange ventilation som en funktion av syre, är här som en funktion av koldioxid (CO 2) och igen, som i figur 1, höll partialtrycket av O 2 ständigt 100 mm Hg. I motsats till Bild. 1, denna kurva, något som liknar en linjär linje. Det är, för att ändra trycket av CO 2 lite ändrade andas samma lite, i en speciell relation. Och man kan tro, som beskrivs till vänster att detta förhållande skulle vara 1:01, och det skulle i sig om vi inte hade haft en kolsyrad buffert fungerar systemet på följande: Vår blodplasmas pH är nästan konstant runt. 7,4 och de två viktigaste buffertar för att hålla denna konstant: Bikarbonat: HCO - 3 och kolsyra: H 2 CO 3. Deras process kan gå på två ställen i blodet och i erytrocyter. Den enda skillnaden är att processen av blod har en mycket lång forløbstid, med konstant k = 0,037 s -1, medan om det resulterar i röda blodkroppar, påskyndat processen av zink (II)-innehållande enzym: carbonid anhydrase, vilket snabbar på vattenkraft av extern process med ca. 10 7 (jämfört med den tidigare nämnda k). Allt detta buffert systemet gör så att grafen är en rät linje med ekvationen y = x, utan snarare med y = 0, n ∙ x.
Det är faktiskt sett för ventilation av lungorna öka som en följd av ökade PCO 2, beror på samma kemo-receptorer, men är mer reaktiv till CO 2 än för O 2. Detta ger en rak linje. Och det även ses på grafen 1.akse att receptorerna är mer reaktiva än CO 2, eftersom värdena, så att säga, närmare varandra, säger det att endast en liten ndring av trycket orsakar en relativt stor förändring i lungventilation. Anledningen till detta intervall på axeln bara går från 38 till 50, är att vi inte naturligt vill hitta händelser med ökat tryck, skulle detta kräva någon form av ren förbränning av organiskt material, exempelvis ett bål av ett slag.
b: Om kroppens arbetar vävnader utför ett hårt arbete, denna vävnad celler ett stort behov av syre. Och i och de får denna stora mängd syre som de producerar mycket CO 2, eftersom rester från respirationsprocessen. Och allt detta koldioxid din kropp kommer att vilja bli av med, därför trycket av CO 2 i venerna, som transporterar afiltede blodet tillbaka till hjärtats högra förmak där det då ingår i den lilla kretsen (pulmonell cirkulation), därför kommer det att finnas en stor mängd CO 2 i det venösa blodet, och det kommer att finnas ett stort tryck på O 2, eftersom de flesta om inte alla syre har använts.
Anledningen till att vår arteriella partialtrycket av CO 2 och O 2 inte har förändrats mycket, är att vår kropp har olika mekanismer för att kontrollera andning, så att kan bära den nödvändiga mängden syre och därmed koldioxid till olika organ och vävnader kroppen. Det primära systemet som styr vår andning är de tidigare nämnda andningscentrum som styr musklerna i mellangärdet och runt 12 (på varje sida) revben. Och andningscentrum kommer särskilt dess signaler från H + joner som bildats som ett resultat av en hydro-lysering aktivitet i hjärnan. Hjärnan är omgiven av ca. 150 ml (genereras dagligen ca. 500 ml, vilket tyder på hög aktivitet, och därmed hög separation), cerebrospinalvätska (CSF (eng. Cerebrospinalvätska)) och ett ämne som dock kan diffundera in denna vätska är CO 2, som hydrolyseras i vätskan, och därför utgör kolsyra, och därmed bikarbonat och fria H +, vilket leder till lägre pH. CSF har ingen buffert, så en liten förändring i pH, omedelbart kommer att påverka det centrala cellgifterna receptorer andningscentrum, vilket leder till ökad ventilation, och därför inte ändras partialtrycket.
Källor: Fysiologi (Routledge), Wikipedia.org
respiratoriska djup * andningsfrekvens = lungventilation
Och det gör att en förändring, vår andningscentrum som ligger i den utvidgade delen av ryggmärgen, förlängda märgen . Men för att förändra vår Ventilation måste ske tämligen omfattande ändringar ip (O 2). För när vi vet att trycket av CO 2 var konstant, förändringar i pH inte stor, men så vi kan se igen från kurvans form som också måste vara en ganska stor förändring så att ventilationen ökar.
Figur 2 (visas inte) visar samma som figur 1 men istället för att ange ventilation som en funktion av syre, är här som en funktion av koldioxid (CO 2) och igen, som i figur 1, höll partialtrycket av O 2 ständigt 100 mm Hg. I motsats till Bild. 1, denna kurva, något som liknar en linjär linje. Det är, för att ändra trycket av CO 2 lite ändrade andas samma lite, i en speciell relation. Och man kan tro, som beskrivs till vänster att detta förhållande skulle vara 1:01, och det skulle i sig om vi inte hade haft en kolsyrad buffert fungerar systemet på följande: Vår blodplasmas pH är nästan konstant runt. 7,4 och de två viktigaste buffertar för att hålla denna konstant: Bikarbonat: HCO - 3 och kolsyra: H 2 CO 3. Deras process kan gå på två ställen i blodet och i erytrocyter. Den enda skillnaden är att processen av blod har en mycket lång forløbstid, med konstant k = 0,037 s -1, medan om det resulterar i röda blodkroppar, påskyndat processen av zink (II)-innehållande enzym: carbonid anhydrase, vilket snabbar på vattenkraft av extern process med ca. 10 7 (jämfört med den tidigare nämnda k). Allt detta buffert systemet gör så att grafen är en rät linje med ekvationen y = x, utan snarare med y = 0, n ∙ x.
Det är faktiskt sett för ventilation av lungorna öka som en följd av ökade PCO 2, beror på samma kemo-receptorer, men är mer reaktiv till CO 2 än för O 2. Detta ger en rak linje. Och det även ses på grafen 1.akse att receptorerna är mer reaktiva än CO 2, eftersom värdena, så att säga, närmare varandra, säger det att endast en liten ndring av trycket orsakar en relativt stor förändring i lungventilation. Anledningen till detta intervall på axeln bara går från 38 till 50, är att vi inte naturligt vill hitta händelser med ökat tryck, skulle detta kräva någon form av ren förbränning av organiskt material, exempelvis ett bål av ett slag.
b: Om kroppens arbetar vävnader utför ett hårt arbete, denna vävnad celler ett stort behov av syre. Och i och de får denna stora mängd syre som de producerar mycket CO 2, eftersom rester från respirationsprocessen. Och allt detta koldioxid din kropp kommer att vilja bli av med, därför trycket av CO 2 i venerna, som transporterar afiltede blodet tillbaka till hjärtats högra förmak där det då ingår i den lilla kretsen (pulmonell cirkulation), därför kommer det att finnas en stor mängd CO 2 i det venösa blodet, och det kommer att finnas ett stort tryck på O 2, eftersom de flesta om inte alla syre har använts.
Anledningen till att vår arteriella partialtrycket av CO 2 och O 2 inte har förändrats mycket, är att vår kropp har olika mekanismer för att kontrollera andning, så att kan bära den nödvändiga mängden syre och därmed koldioxid till olika organ och vävnader kroppen. Det primära systemet som styr vår andning är de tidigare nämnda andningscentrum som styr musklerna i mellangärdet och runt 12 (på varje sida) revben. Och andningscentrum kommer särskilt dess signaler från H + joner som bildats som ett resultat av en hydro-lysering aktivitet i hjärnan. Hjärnan är omgiven av ca. 150 ml (genereras dagligen ca. 500 ml, vilket tyder på hög aktivitet, och därmed hög separation), cerebrospinalvätska (CSF (eng. Cerebrospinalvätska)) och ett ämne som dock kan diffundera in denna vätska är CO 2, som hydrolyseras i vätskan, och därför utgör kolsyra, och därmed bikarbonat och fria H +, vilket leder till lägre pH. CSF har ingen buffert, så en liten förändring i pH, omedelbart kommer att påverka det centrala cellgifterna receptorer andningscentrum, vilket leder till ökad ventilation, och därför inte ändras partialtrycket.
Källor: Fysiologi (Routledge), Wikipedia.org
Något om: Thomas Edison
Thomas Alva Edison föddes den 11 Februari 1847 och dog den 18 Oktober 1931. Han var en driftig uppfinnare och affärsman. Bland hans många uppfinningar är förbättringen av glödlampan och fonografen som de antagligen bäst.
Här följer en lång citat på engelska, som han gav till amerikansk tv i 1920:
"Innan experiment på glödande elektriska ljuset systemet, Understanding många utformat så, att ett generellt system som skulle möjliggöra en uppdelning av ljus i mindre enheter motsvarande två gas jetplan och med kommersiella ekonomin bättre än det rådande gassystemet. Tanken var om det var att vara framgångsrik, enheterna måste alla arbetat i föröka sig. Detta gjorde det nödvändigt att skapa lampor av mycket hög resistens till att minska de enorma investeringar i koppar vid behov, om lägre motstånd lampor skulle användas. (För säkerhets ?) Detta krävde Identifiera hår liknande trådar med hög luft-motstånd material. I oktober tjugoförsta 1871, experiment gav åtskilliga i produktionen av en liten lampa enhet jämförelsevis enormt motstånd. Glödtråden är? under förhållanden av stor stabilitet efter detta resultat, jag visste problemet närmade kommersiell lösning. Eftersom dessa lampa experiment fortsätta, andra delar av det allmänna systemet var aktivt experimenterade på. generatorn så enkelt som åberopas, var extremt ineffektiv, förlusten närmar sig femtio procent på grund av ett missförstånd bland elektriker som jag aldrig förstod. emellertid experiment gav dessa en dynamo som nittio procent av den energi som var till nytta. Sen mätare för att mäta den aktuella användes av tusentals kunder och även en mängd tillbehör som underjordisk kanal, kretsar, uttag, en Cetera krävdes två göra ett komplett system för distribution, som alla var åstadkomma ... "
Dessutom är han framför allt känd för kapacitet: "geni är 1% inspiration och 99% hårt arbete"
Här följer en lång citat på engelska, som han gav till amerikansk tv i 1920:
"Innan experiment på glödande elektriska ljuset systemet, Understanding många utformat så, att ett generellt system som skulle möjliggöra en uppdelning av ljus i mindre enheter motsvarande två gas jetplan och med kommersiella ekonomin bättre än det rådande gassystemet. Tanken var om det var att vara framgångsrik, enheterna måste alla arbetat i föröka sig. Detta gjorde det nödvändigt att skapa lampor av mycket hög resistens till att minska de enorma investeringar i koppar vid behov, om lägre motstånd lampor skulle användas. (För säkerhets ?) Detta krävde Identifiera hår liknande trådar med hög luft-motstånd material. I oktober tjugoförsta 1871, experiment gav åtskilliga i produktionen av en liten lampa enhet jämförelsevis enormt motstånd. Glödtråden är? under förhållanden av stor stabilitet efter detta resultat, jag visste problemet närmade kommersiell lösning. Eftersom dessa lampa experiment fortsätta, andra delar av det allmänna systemet var aktivt experimenterade på. generatorn så enkelt som åberopas, var extremt ineffektiv, förlusten närmar sig femtio procent på grund av ett missförstånd bland elektriker som jag aldrig förstod. emellertid experiment gav dessa en dynamo som nittio procent av den energi som var till nytta. Sen mätare för att mäta den aktuella användes av tusentals kunder och även en mängd tillbehör som underjordisk kanal, kretsar, uttag, en Cetera krävdes två göra ett komplett system för distribution, som alla var åstadkomma ... "
Dessutom är han framför allt känd för kapacitet: "geni är 1% inspiration och 99% hårt arbete"
Proportioner / Tvist
Med mänskliga proportioner förstått sambandet mellan olika mänskliga delar och relationen mellan människor själva. Alla människor, inklusive alla mönster, bygger på de grundläggande mänskliga proportioner. Förutom det förhållandet ses i Fibonacci serie tal, hela människokroppen:
Fibonacci serie siffror kan ses överallt i naturen, t.ex. förhållandet mellan underarmen och leder hand i fingrarna, längd och höjd i ansikte, etc etc.
Eftersom alla modeller är baserade på mänskliga proportioner, och den mänskliga proportioner har en anslutning till Fibonacci-tal, den totala utformningen indirekt även ha en relation med Fibonacci. Alla naturliga och mänskliga bygger också på Fibonacci relationer och därför måste också passa proportionerna av mänskliga proportioner.
Vi kan därför dra slutsatsen att allt omkring oss i vardagen, passar teorin vår proportioner. Men vi hitta saker som inte passar oss.
Har identifierats som inklusive idealmål fibonaccitallene beräknas efter. Problemet är att ingen uppfyller dessa mål. T.ex. skulle jag, om du fanns i mitt huvud storlek till 1.84m. hög, men jag är bara 1,80. Samma höjd borde egentligen vara samma som 8 av era huvuden placeras ovanpå varandra. Det finns många sådana bestämmelser, och även om de ofta komma nära, är en human aldrig till hundra procent perfekt.
Dessutom kommer människor som har olika höjd, och några har funktionshinder, som hindrar dem från att göra vad andra människor gör. Det är därför, vid konstruktion, inte bara ta Fibonacci serie siffror och idealiska mål, men vi måste göra produkter som fungerar på olika grader av störningar: en stol som kan vara i höjd varieras, bälten, en justerbar sadel, glas, etc, etc. tillgängliga produkter som kan justeras mycket och är tänkt att kunna användas av personer med många och stora avvikelser, och det finns produkter där användaren måste tillhöra en mycket specifik målgrupp.
Fibonacci serie siffror kan ses överallt i naturen, t.ex. förhållandet mellan underarmen och leder hand i fingrarna, längd och höjd i ansikte, etc etc.
Eftersom alla modeller är baserade på mänskliga proportioner, och den mänskliga proportioner har en anslutning till Fibonacci-tal, den totala utformningen indirekt även ha en relation med Fibonacci. Alla naturliga och mänskliga bygger också på Fibonacci relationer och därför måste också passa proportionerna av mänskliga proportioner.
Vi kan därför dra slutsatsen att allt omkring oss i vardagen, passar teorin vår proportioner. Men vi hitta saker som inte passar oss.
Har identifierats som inklusive idealmål fibonaccitallene beräknas efter. Problemet är att ingen uppfyller dessa mål. T.ex. skulle jag, om du fanns i mitt huvud storlek till 1.84m. hög, men jag är bara 1,80. Samma höjd borde egentligen vara samma som 8 av era huvuden placeras ovanpå varandra. Det finns många sådana bestämmelser, och även om de ofta komma nära, är en human aldrig till hundra procent perfekt.
Dessutom kommer människor som har olika höjd, och några har funktionshinder, som hindrar dem från att göra vad andra människor gör. Det är därför, vid konstruktion, inte bara ta Fibonacci serie siffror och idealiska mål, men vi måste göra produkter som fungerar på olika grader av störningar: en stol som kan vara i höjd varieras, bälten, en justerbar sadel, glas, etc, etc. tillgängliga produkter som kan justeras mycket och är tänkt att kunna användas av personer med många och stora avvikelser, och det finns produkter där användaren måste tillhöra en mycket specifik målgrupp.
släktträd för fisk
Syfte
Syftet med denna studie och motsvarande resultat är att fastställa släktskapet med ett antal fiskar och skaldjur. Detta måste göras först att få kunskap om metoden, som är elektrofores av proteiner i stället för kärnämne, men även delvis att göra lite evolutionära skäl att slutligen komma med ett släktträd.
Teori
Karta över evolution och genetik
Om man betraktar sammansättningen och mångfald av djur på jorden, från en darwinistisk synpunkt, är en uppfattning av alla djur är skapade från samma förfader, som här skulle vara en liten procaryote organismer. Denna organism borde ha multiplicerat med en hel del nya arter, som i sin tur skulle ha utvecklats till nya arter och underarter. Anledningen till att det i dag är så rik på vilt med fåglar, fiskar och andra djur mark att alla dessa personer har val trycket på annat märke från sina kamrater så att de bättre kan utnyttja en specifik nisch. Som ett exempel på detta, vi giraff, Giraffa Camelopardalis, lever främst från bladen på höga akacia, som ingen annan kan nå. Det kommer från Okapi som då har ett urval tryck att isolera sig, nisch differentiering, Okapi, så att den kan nå de höga blad, och du har tittat på vägen för en lång tid, vilket skapar två arter. Detta exempel på giraffen får inte ses som Jean Baptist Lamarc gjorde det med att man genom giraffens liv, kommer det att få längre hals, men det uppstår spontana mutationer som gör det en längre hals, och att hans barn kommer att ha bättre bärkraften som ett resultat av mer mat, vilket leder gen / fastighet med dem.
Man ser på detta från ett molekylärt perspektiv, kan man använda den för att studera deras ursprung, kan en titt på vilka proteiner som olika individer har, och då bland annat ta reda på hur gammalt protein är och vad djuren i familjen med vem. Hela denna gren av biologi, så läran om ärftlighet eller genetik är alltså studiet av levande organismer kommer deras utveckling och ärvda egenskaper genom studier av gener. Med andra ord, betydelsen av arv och variation när en organism skapas och utvecklas. Och det var i första hand uppstod när folk började bli intresserad av, från vilken de mänskliga stammar.
Analog och homologa utveckling
När de började klassificera djur på jorden, i ett försök att skapa en universell släktträd skulle man behöva veta vilka djur i familjer med vem, och hur nära familjen de var, så det såg ut på likheterna. Och du såg på likheter mellan djur från två olika kriterier: homolog, vilket är ett uttryck för att de har samma förfader, och sedan ett gemensamt arv. Så är en fastighet liknande i två djur, eftersom deras gemensamma anfader hade fastigheten. Analog är motsatsen, här ser likadan ut, inte för att de har samma grundläggande form, men eftersom den evolutionära processen har utvecklat samma egenskaper, t.ex. utveckling är också kallas konvergent utveckling. En annan nackdel med denna typ av utveckling kallas avvikande utveckling, och är ett uttryck för två djur som är homolog i samma klass (samma grundläggande form) men är annorlunda eftersom de har utvecklats i två olika riktningar.
Art protein sammansättning
Det som är spännande arter protein sammansättning är att från detta, kan se varifrån de har sitt ursprung kan man också ganska exakt datera protein ålder, för om två djur, såsom fisk, har samma protein, så det är samma protein, förstås så att de två proteinerna i princip skulle kunna uppstå från mutationer självständigt, men sannolikheten för detta är mycket nära noll. Så om du hittar samma protein i två arter, kan en med säkerhet säga att de har samma förfader, men endast på en jämförelse av proteiner, kan man inte nödvändigtvis säga något mer om när de har utvecklats bort från deras gemensamma stamfader. Till exempel har vi i försöket ingick en aktin-myosin protein lösning, och spännande med detta är att det är en av de viktigaste muskelproteiner av mänsklig muskelvävnad är uppbyggd. Har fisken även detta kan man säga mycket om protein ålder, för det är som jag sa, riktigt länge sedan att den mänskliga stamceller form och fisk, skiljde sig från varandra.
Något annat som proteiner visar naturligtvis också sammansättningen av DNA, eftersom det är DNA som i slutändan kodar för proteiner en viss cell kan producera.
Metod
se Motion Guide.
Fisk och skaldjur som vi använde för våra försök var följande:
1. Räkor (saltvatten) - räkor
2. Krabbtaska - Cancer pagurus
3. Torsk - Gadus morhua
4. Pollock - Pollachius virens
5. Sill - Glupea harengus
6. Fjärsing - Trachinidae
7. Hälleflundra - Reinhardtius hippoglossoides
8. Rödspätta - Pleuronectes platessa
Hypotes
Innan du fått tillgång till avancerad molekylärbiologi verktyg vi har i dag gjort stammen av träd från andra kriterier. Mån såg främst till utseende och livsmiljöer jag har också tänkt som en hypotes för att skapa ett släktträd utifrån dessa kriterier, senare för att se hur exakt den är jämfört med den molekylärbiologiska metoden.
Att ge en ganska realistisk träd, måste vi utforska olika levnadsvillkor för olika fisk och skaldjur. Det första vi ser är att de alla saltvattenfisk, detta är inte så betydande jämfört med muskel proteiner, men hjälper till att förstå deras ursprung. Man kan alltså tänka sig att även i gamla tider, har varit en skiljelinje mellan den fisk som lever i sötvatten, och de som levde i saltvatten.
Andra kan vi se att de alla har gälar, är detta givetvis också en egenskap som är unik för just fisk och skaldjur, en enkel iakttagelse, men det visar att de alla har samma förfader, men återigen långt bak. Men det är bara inte alla marina djur som har gälar, till exempel sköldpaddor, saltvatten krokodiler, valar och sälar.
Resultat
Nedan är en genomsökning av gel, som det såg ut efter elektrofores. Vi hade två bilder att välja på, detta var den starkaste ren färg regelbundet, och jag valde den för just detta skäl. För den andra gelen var band mycket svaga, och det var därför svårt att skilja mellan de olika enskilda banden. Jag tror att vi kan förbättra detta.
Wells innehålla följande:
1: Kalejdoskop standard 2: myosin-aktin standard 30-10: fisk (se metod för sekvens).
Du kan beställa nu bestämma ett protein som uppskattas av denna modell (Bild 5) .. Om du känner till deras vikt kan man se hur mycket den skulle ha horisontella och vice versa, kan man hitta sin vikt genom att se på migration. Detta kan vi använda för att ta reda på vilka proteiner i fisk (se liste1).
Ett protein som bara räkor och taskekrappen har sett som bandet har funnits runt 8 mm och därmed 5 kD motsvarar detta thymosin. Räkor och taskekrappen därmed både protein, som i sin tur av annan fisk har, detta ger upphov till en gemensam förfader som har utvecklats bort från fisken. Ett band att nästan all fisk och skaldjur har och som är horisontellt runt 4,6 mm Kan nebulin. Det är att de alla har ett band vid denna tidpunkt, måste talar om protein här vara mycket gamla eftersom det har funnits i olika arter nu gemensam förfader, är det protein arbetar också i samarbete med aktin, vilket jag senare kommer att visa att de alla har, så därför du har en, det var ofta den andra, annars protein (i detta fall aktin) fungerar inte optimalt om det beror på att huvudet skulle fungera. En av de första att bli upptäckt, är att de alla har ett band som har övergripande 4 mm Detta är enligt vår modell av myosin. Det är som en gammal aktin protein som förekommer i alla arter. Något annat som också är unikt i myosin-aktin som bildats i all fisk är att det är det är samma muskel proteiner, som vi människor och de flesta djur har. Detta säger oss att säga, det är en otroligt gammal protein till oss, har fåglar och fiskar gemensam förfader hade det och detta förfader är flera miljoner år sedan. Detta säger också något om proteinet status. De har varit mycket viktigt och viktigt för djuren och inte bara det, de har också uppenbarligen fungerat optimalt på lika många år, eftersom det inte hade vad som skulle en andra, mer muskler protein har ersatt den ganska snabbt, och med andra, skulle mer protein ha en bättre chans att överleva. Proteinet aktin, som också är en mycket viktig protein, finner vi ett stycke längre ned, vid ungefär 5,3 mm . Det är dock lite oklart att se hur många människor har detta protein, men ummidelbart jag skulle tro att det var mest. De två proteinerna samverkar nämligen, man kan inte fungera utan det andra och vice versa.
Om vi nu gå in och titta på vad fisk i familjer med varandra, vi sedan snabbt för torsk och Pollock är mycket lika, inte bara till utseendet, men särskilt i protein sammansättning, men även sill, många homolog band med två. Det är därför, ur detta synsätt säkert att säga att rödspätta och torsk är familj och att de har en homolog utveckling, sill, har dock utvecklats till en andra urtaget, och genom selektiva tryck och mutation, det så och säga ändrat riktning jämfört med torsk och Pollock.
Hälleflundra och rödspätta är också tydligt från proteinet krets i familjen, och därmed en homolog utveckling påminner de fortfarande varandra mycket. Däremot kan man säga att rock skivan är en äldre art, eftersom dess ögon mer som en "vanlig" fisk som har ögonen på båda sidor, medan flundra har båda ögonen på samma sida. Ingen mugg visar sig också vara familjen av de två eftersom de har mycket liknande band. Man kan dock titta på mina tidigare släktträd som jag har placerat dem i samma art grupp, men det är också tillverkat av ett rent utseende synvinkel. Inget ansikte har förändrats avsevärt sedan slits mellan den och rödspätta. Detta fenomen att en fisk inte liknar något från naturen det verkligen tillhör, utan att den snarare liknar en annan grupp kallas en polyfyletisk grupp (säger det som det ser ut som det tillhör). Räkor och taskekrappen ser mycket olika, men de har vissa homologa band, eftersom ingen av de andra. (Se opg 2).
Diskussion
Det fanns bara en verklig källa till fel, men det var också av stor betydelse. Nämligen att våra elektrofores inte fick köra tillräckligt länge. Detta innebär att banden inte skulle ha gått så långt och att det därför inte finns så mycket sprids på. Skillnaden mellan band annars hade gjort två uppgiften betydligt lättare. Det är därför svårt att avgöra vilka fiskar har proteiner. Ribbon densitet har också påverkat fastställandet av släktskap mellan fisk. Men det är också viktigt att säga här att även de två banden har gått samma längd, är det inte nödvändigtvis samma protein. För proteiner består som sagt av olika aminosyror och sammansättningen av molekyler skiljer sig åt och därmed också deras vikt. Så du kan säga mycket väl ha två olika proteiner med samma molekylvikt. Metoden att bestämma slægsskab Jag tror ummidelbart, med min begränsade kunskap om andra metoder är bra nog, om så bara experiment är välgjord.
Syftet med denna studie och motsvarande resultat är att fastställa släktskapet med ett antal fiskar och skaldjur. Detta måste göras först att få kunskap om metoden, som är elektrofores av proteiner i stället för kärnämne, men även delvis att göra lite evolutionära skäl att slutligen komma med ett släktträd.
Teori
Karta över evolution och genetik
Om man betraktar sammansättningen och mångfald av djur på jorden, från en darwinistisk synpunkt, är en uppfattning av alla djur är skapade från samma förfader, som här skulle vara en liten procaryote organismer. Denna organism borde ha multiplicerat med en hel del nya arter, som i sin tur skulle ha utvecklats till nya arter och underarter. Anledningen till att det i dag är så rik på vilt med fåglar, fiskar och andra djur mark att alla dessa personer har val trycket på annat märke från sina kamrater så att de bättre kan utnyttja en specifik nisch. Som ett exempel på detta, vi giraff, Giraffa Camelopardalis, lever främst från bladen på höga akacia, som ingen annan kan nå. Det kommer från Okapi som då har ett urval tryck att isolera sig, nisch differentiering, Okapi, så att den kan nå de höga blad, och du har tittat på vägen för en lång tid, vilket skapar två arter. Detta exempel på giraffen får inte ses som Jean Baptist Lamarc gjorde det med att man genom giraffens liv, kommer det att få längre hals, men det uppstår spontana mutationer som gör det en längre hals, och att hans barn kommer att ha bättre bärkraften som ett resultat av mer mat, vilket leder gen / fastighet med dem.
Man ser på detta från ett molekylärt perspektiv, kan man använda den för att studera deras ursprung, kan en titt på vilka proteiner som olika individer har, och då bland annat ta reda på hur gammalt protein är och vad djuren i familjen med vem. Hela denna gren av biologi, så läran om ärftlighet eller genetik är alltså studiet av levande organismer kommer deras utveckling och ärvda egenskaper genom studier av gener. Med andra ord, betydelsen av arv och variation när en organism skapas och utvecklas. Och det var i första hand uppstod när folk började bli intresserad av, från vilken de mänskliga stammar.
Analog och homologa utveckling
När de började klassificera djur på jorden, i ett försök att skapa en universell släktträd skulle man behöva veta vilka djur i familjer med vem, och hur nära familjen de var, så det såg ut på likheterna. Och du såg på likheter mellan djur från två olika kriterier: homolog, vilket är ett uttryck för att de har samma förfader, och sedan ett gemensamt arv. Så är en fastighet liknande i två djur, eftersom deras gemensamma anfader hade fastigheten. Analog är motsatsen, här ser likadan ut, inte för att de har samma grundläggande form, men eftersom den evolutionära processen har utvecklat samma egenskaper, t.ex. utveckling är också kallas konvergent utveckling. En annan nackdel med denna typ av utveckling kallas avvikande utveckling, och är ett uttryck för två djur som är homolog i samma klass (samma grundläggande form) men är annorlunda eftersom de har utvecklats i två olika riktningar.
Art protein sammansättning
Det som är spännande arter protein sammansättning är att från detta, kan se varifrån de har sitt ursprung kan man också ganska exakt datera protein ålder, för om två djur, såsom fisk, har samma protein, så det är samma protein, förstås så att de två proteinerna i princip skulle kunna uppstå från mutationer självständigt, men sannolikheten för detta är mycket nära noll. Så om du hittar samma protein i två arter, kan en med säkerhet säga att de har samma förfader, men endast på en jämförelse av proteiner, kan man inte nödvändigtvis säga något mer om när de har utvecklats bort från deras gemensamma stamfader. Till exempel har vi i försöket ingick en aktin-myosin protein lösning, och spännande med detta är att det är en av de viktigaste muskelproteiner av mänsklig muskelvävnad är uppbyggd. Har fisken även detta kan man säga mycket om protein ålder, för det är som jag sa, riktigt länge sedan att den mänskliga stamceller form och fisk, skiljde sig från varandra.
Något annat som proteiner visar naturligtvis också sammansättningen av DNA, eftersom det är DNA som i slutändan kodar för proteiner en viss cell kan producera.
Metod
se Motion Guide.
Fisk och skaldjur som vi använde för våra försök var följande:
1. Räkor (saltvatten) - räkor
2. Krabbtaska - Cancer pagurus
3. Torsk - Gadus morhua
4. Pollock - Pollachius virens
5. Sill - Glupea harengus
6. Fjärsing - Trachinidae
7. Hälleflundra - Reinhardtius hippoglossoides
8. Rödspätta - Pleuronectes platessa
Hypotes
Innan du fått tillgång till avancerad molekylärbiologi verktyg vi har i dag gjort stammen av träd från andra kriterier. Mån såg främst till utseende och livsmiljöer jag har också tänkt som en hypotes för att skapa ett släktträd utifrån dessa kriterier, senare för att se hur exakt den är jämfört med den molekylärbiologiska metoden.
Att ge en ganska realistisk träd, måste vi utforska olika levnadsvillkor för olika fisk och skaldjur. Det första vi ser är att de alla saltvattenfisk, detta är inte så betydande jämfört med muskel proteiner, men hjälper till att förstå deras ursprung. Man kan alltså tänka sig att även i gamla tider, har varit en skiljelinje mellan den fisk som lever i sötvatten, och de som levde i saltvatten.
Andra kan vi se att de alla har gälar, är detta givetvis också en egenskap som är unik för just fisk och skaldjur, en enkel iakttagelse, men det visar att de alla har samma förfader, men återigen långt bak. Men det är bara inte alla marina djur som har gälar, till exempel sköldpaddor, saltvatten krokodiler, valar och sälar.
Resultat
Nedan är en genomsökning av gel, som det såg ut efter elektrofores. Vi hade två bilder att välja på, detta var den starkaste ren färg regelbundet, och jag valde den för just detta skäl. För den andra gelen var band mycket svaga, och det var därför svårt att skilja mellan de olika enskilda banden. Jag tror att vi kan förbättra detta.
Wells innehålla följande:
1: Kalejdoskop standard 2: myosin-aktin standard 30-10: fisk (se metod för sekvens).
Du kan beställa nu bestämma ett protein som uppskattas av denna modell (Bild 5) .. Om du känner till deras vikt kan man se hur mycket den skulle ha horisontella och vice versa, kan man hitta sin vikt genom att se på migration. Detta kan vi använda för att ta reda på vilka proteiner i fisk (se liste1).
Ett protein som bara räkor och taskekrappen har sett som bandet har funnits runt 8 mm och därmed 5 kD motsvarar detta thymosin. Räkor och taskekrappen därmed både protein, som i sin tur av annan fisk har, detta ger upphov till en gemensam förfader som har utvecklats bort från fisken. Ett band att nästan all fisk och skaldjur har och som är horisontellt runt 4,6 mm Kan nebulin. Det är att de alla har ett band vid denna tidpunkt, måste talar om protein här vara mycket gamla eftersom det har funnits i olika arter nu gemensam förfader, är det protein arbetar också i samarbete med aktin, vilket jag senare kommer att visa att de alla har, så därför du har en, det var ofta den andra, annars protein (i detta fall aktin) fungerar inte optimalt om det beror på att huvudet skulle fungera. En av de första att bli upptäckt, är att de alla har ett band som har övergripande 4 mm Detta är enligt vår modell av myosin. Det är som en gammal aktin protein som förekommer i alla arter. Något annat som också är unikt i myosin-aktin som bildats i all fisk är att det är det är samma muskel proteiner, som vi människor och de flesta djur har. Detta säger oss att säga, det är en otroligt gammal protein till oss, har fåglar och fiskar gemensam förfader hade det och detta förfader är flera miljoner år sedan. Detta säger också något om proteinet status. De har varit mycket viktigt och viktigt för djuren och inte bara det, de har också uppenbarligen fungerat optimalt på lika många år, eftersom det inte hade vad som skulle en andra, mer muskler protein har ersatt den ganska snabbt, och med andra, skulle mer protein ha en bättre chans att överleva. Proteinet aktin, som också är en mycket viktig protein, finner vi ett stycke längre ned, vid ungefär 5,3 mm . Det är dock lite oklart att se hur många människor har detta protein, men ummidelbart jag skulle tro att det var mest. De två proteinerna samverkar nämligen, man kan inte fungera utan det andra och vice versa.
Om vi nu gå in och titta på vad fisk i familjer med varandra, vi sedan snabbt för torsk och Pollock är mycket lika, inte bara till utseendet, men särskilt i protein sammansättning, men även sill, många homolog band med två. Det är därför, ur detta synsätt säkert att säga att rödspätta och torsk är familj och att de har en homolog utveckling, sill, har dock utvecklats till en andra urtaget, och genom selektiva tryck och mutation, det så och säga ändrat riktning jämfört med torsk och Pollock.
Hälleflundra och rödspätta är också tydligt från proteinet krets i familjen, och därmed en homolog utveckling påminner de fortfarande varandra mycket. Däremot kan man säga att rock skivan är en äldre art, eftersom dess ögon mer som en "vanlig" fisk som har ögonen på båda sidor, medan flundra har båda ögonen på samma sida. Ingen mugg visar sig också vara familjen av de två eftersom de har mycket liknande band. Man kan dock titta på mina tidigare släktträd som jag har placerat dem i samma art grupp, men det är också tillverkat av ett rent utseende synvinkel. Inget ansikte har förändrats avsevärt sedan slits mellan den och rödspätta. Detta fenomen att en fisk inte liknar något från naturen det verkligen tillhör, utan att den snarare liknar en annan grupp kallas en polyfyletisk grupp (säger det som det ser ut som det tillhör). Räkor och taskekrappen ser mycket olika, men de har vissa homologa band, eftersom ingen av de andra. (Se opg 2).
Diskussion
Det fanns bara en verklig källa till fel, men det var också av stor betydelse. Nämligen att våra elektrofores inte fick köra tillräckligt länge. Detta innebär att banden inte skulle ha gått så långt och att det därför inte finns så mycket sprids på. Skillnaden mellan band annars hade gjort två uppgiften betydligt lättare. Det är därför svårt att avgöra vilka fiskar har proteiner. Ribbon densitet har också påverkat fastställandet av släktskap mellan fisk. Men det är också viktigt att säga här att även de två banden har gått samma längd, är det inte nödvändigtvis samma protein. För proteiner består som sagt av olika aminosyror och sammansättningen av molekyler skiljer sig åt och därmed också deras vikt. Så du kan säga mycket väl ha två olika proteiner med samma molekylvikt. Metoden att bestämma slægsskab Jag tror ummidelbart, med min begränsade kunskap om andra metoder är bra nog, om så bara experiment är välgjord.
Naturen i Design
Om vi tittar på ett sådant område som en bit orörd skog, kan alla komma överens om (om de inte tror att en jätte spaghetti monster skapade jorden) att allt som sker är på grund av evolution. Anledningen till att träden inte är en tjugo centimeter hög, och ekorrar är inte neon gröna är att under miljontals år, på grund av det naturliga urvalet, ganska träff vad som kan vara det optimala. Om en ekorre föddes med en glödande neon grön färg, skulle den inte kunna gömma sig från rovdjur snabbt ätas, har inga barn och de självlysande egendom skulle stanna där.
Men är evolution och naturligt urval inte också någon annanstans än i orörd natur? Till exempel i design. Säga att jag gjorde en mugg. När jag gör en mugg, ägnar jag mycket av den erfarenhet jag redan har att bedöma mugg, vilket är ergonomiskt bra att hålla i handen - rätt volym, etc., etc. Den erfarenhet jag har i huvudsak från andra muggarna jag har haft eller kanske bara ett jag sett i ett bok. Jag vet att du kan få inspiration från många andra ställen än någon annan mugg, utan till tankeexperiment att arbeta, måste du förmodligen att skära kanterna extra knapert, och andra cuper annars i de flesta fall vara en stor inspirationskälla. Låt oss därför säga att min redesigned cup kommer att vara summan av alla de goda egenskaper som smittkoppor, som har korsat min väg har. Om min kopp hamnar som uppfyller kriterierna som gör det en god kopp, kommer det förmodligen bli en framgång. Så det kommer att produceras i stora mängder och det kommer att komma i böcker, Internet etc. Detta sätt, många människor lär sig denna bägare att veta, och vissa av dem kan vara designers som konstruerar en andra kopp som tar vissa delar ur min kopp. Om min kopp befinns inte att fungera och blir en flopp, kommer det inte framställts i särskilt stora mängder, inte komma i böcker och på Internet och kommer som neon grön ekorre inte genomföra sina egenskaper vidare.
Så man kan säga att det naturliga urvalet också gäller design. Om vi som människor och kultur som en del av naturen, som kanske skulle fungera sparas. I detta fall är alla bland människor, vilket ju också "natur", kan förklaras med naturligt urval. Men många ser detta klyfta mellan natur och kultur, droppar det oss kanske inte kom naturligt till denna slutsats.
Men är evolution och naturligt urval inte också någon annanstans än i orörd natur? Till exempel i design. Säga att jag gjorde en mugg. När jag gör en mugg, ägnar jag mycket av den erfarenhet jag redan har att bedöma mugg, vilket är ergonomiskt bra att hålla i handen - rätt volym, etc., etc. Den erfarenhet jag har i huvudsak från andra muggarna jag har haft eller kanske bara ett jag sett i ett bok. Jag vet att du kan få inspiration från många andra ställen än någon annan mugg, utan till tankeexperiment att arbeta, måste du förmodligen att skära kanterna extra knapert, och andra cuper annars i de flesta fall vara en stor inspirationskälla. Låt oss därför säga att min redesigned cup kommer att vara summan av alla de goda egenskaper som smittkoppor, som har korsat min väg har. Om min kopp hamnar som uppfyller kriterierna som gör det en god kopp, kommer det förmodligen bli en framgång. Så det kommer att produceras i stora mängder och det kommer att komma i böcker, Internet etc. Detta sätt, många människor lär sig denna bägare att veta, och vissa av dem kan vara designers som konstruerar en andra kopp som tar vissa delar ur min kopp. Om min kopp befinns inte att fungera och blir en flopp, kommer det inte framställts i särskilt stora mängder, inte komma i böcker och på Internet och kommer som neon grön ekorre inte genomföra sina egenskaper vidare.
Så man kan säga att det naturliga urvalet också gäller design. Om vi som människor och kultur som en del av naturen, som kanske skulle fungera sparas. I detta fall är alla bland människor, vilket ju också "natur", kan förklaras med naturligt urval. Men många ser detta klyfta mellan natur och kultur, droppar det oss kanske inte kom naturligt till denna slutsats.
Sötvattenssköldpaddan i Danmark - biologi rapport
Syfte
Det har siktats europeiska sötvattenssköldpaddor (Emys orbicularis) i Danmark, former Salten Å (vi tittar på två här) och Igelsø. Frågan är, kommer varifrån detta? Vi var lastad med två teorier, men en tredjedel finns:
1. En naturlig lärarens tro på att översvämma sköldpadda har överlevt i centrala Jylland, och är inte utrotad 2000 år sedan, som vi trott. De var efter hans vittnesmål inför en liten population av den ursprungliga danska (North European) underarter. Denna överlevnad var åstadkommas utan äkta beskrivs observationer.
2. Att det är inköpt PET är antingen lägga ut ett par kopior, eller att de systematiskt har distribuerats från släktet skulle då dessa från Balkan, Serbien och Ukraina, eftersom det är dessa du kan köpa i djuraffärer.
3. En tredje teori, som vi inte får direkt ut är det att det är en ny underart eller ras de utsatta grupperna i de år som borde ha lagt djur ut (som inte kan vara mer än 100 år, om alls) bör ha evolution till en sub-ras. Detta skulle endast ske om den enskilde muterade, detta är troligt, men sannolikheten uppges vara så liten att denna teori lätt kan avskedas.
Man kan säga mycket om den första teorin, om jag måste göra en kommentar, skulle jag genast kalla det pop-biologi, denna teori locka mycket media intresse, men inte direkt av de stora i sig. Sedan dess har naturen som vi ställs inför kommer inte med några konkreta bevis, utan bara en massa indicier och postulat. Däremot kan man säga att det varit allmänt accepterat, t.ex. kan för nämnas att i en annars mycket informativ online lexikon som Wikipedia, läser vi: "Europeiska damm sköldpadda (Emys orbicularis) återupptäcktes i Danmark, Midtjylland i 1997. " Här måste man säga att de visar att det inte bara är ett fåtal som utsätts exemplar, men en verklig population.
Vårt syfte med detta arbete är att bestämma var dessa sköldpaddor observerats verkligen från. Vi har DNA från Salten Å, Polen, Ukraina, Grekland och Serbien. Om deras DNA matcher med de som kommer från Balkan, måste vi dra slutsatsen att de är utsatta, medan de är annorlunda, kan man säga att de är bevarade kopior av 2000 år gamla Midtjyske underarter.
Teori
Det finns vissa teoretiska ämnen som måste vara här, så jag valde att dela upp det i dessa fyra underteman:
· Europeiska damm sköldpadda:
Den europeiska damm sköldpadda, orbicularis är Emys en sköldpadda som finns i södra och centrala Europa, västra Asien och norra Afrika, men eftersom detta har en sådan utbredd områden beskriver ofta EU som en undeart namngiven Emys orbicularis orbicularis att skilja mellan den och annan också utbredd underart Emys orbicularis orientalis.
Den lever i långsamt rinnande vatten, och övervintra i upp till sju månader. Det är ägg, som många andra reptiler och att de ska kunna kläckas, den varmaste sommaren månadens medeltemperatur överstiger 18 ° C .
· Elektrofores och enzymer begränsning:
En elektrofores är en typ av rening av DNA-bitar. Men innan vi kan gå vidare med elektrofores, bör du har klippt sitt DNA i bitar. För den här användaren mån restriktionsenzymer som är speciellt avsedd för att såga efter en speciell kod. De enzymer vi använde heter ECO R1 och R1 PST, och dessa klippor, respektive av G Eftf. av AATTC och CTGCA Eftf. på G, detta ser ut så här:
När du har klippt DNA i mindre bitar tillägga, en tung markör buffert så att senare i försöket kan se hur mycket DNA-bar är horisontell.
Gelen, som kallas sikten är gjord av agaros, avjoniserat vatten och gel buffert. Agarose är som namnet antyder ett socker (kolhydrater), extraherade från japanska röda alger. Volymen av agarosen avgör hur nära filtret är, du har små sekvenser av DNA vill ha en tät filter, och du lägger därför mycket agaros. När vi tillverkade den upplöstes vi 0,5 gram agaros i 50 ml TAE buffert (se nedan) och värm i mikrovågsugn så att de två ämnena smälte samman. Häll därefter fortfarande flytande gel i badkaret där den stelnar.
När man har ägnat sitt DNA i gelen uppsättningar mån flödet i varje ände av badet. I ena änden är anod (positiva elektroden) och den andra är katoden (negativa elektroden). Det har vänt den gelen så att utgången tilldelades mix i att vända sig bort från anoden. Detta beror på att DNA-molekyler är negativt laddade, så de kommer att gå över till anoden. Resa genom gelen äger rum vid olika hastigheter beroende på molekyl storlek. De större molekylerna långsammare de rör sig genom gelen. Anledningen till att vi har lagt markørbufferen är att det alltid kommer att gå fortare än vissa av de DNA-molekyler, så när markören har kommit ner till den andra änden av Mon strömmen.
· PCR, färg markör och TAE buffert:
En kritisk problem i denna studie är den mängd av DNA för att göra en ordentlig elektrofores, vilket ger en realistisk bild, du måste ha mycket DNA-material. Om du inte kan du använda en molekylärbiologisk reproduktion metod som kallas för PCR, Polymerase Chain Reaction (PCR), som uppfanns redan 1983 av Kary Mullis, som 10 år senare fick Nobels kemi priset för just denna upptäckt. Som namnet antyder är det ett artificiellt producerade replikationsmetode. Det är relativt enkelt, har jag försökt att illustrera det i figuren nedan:
· Steg 1: DNA hälls i en behållare tillsammans med polymeras och fria nukleotider.
· Steg 2: Hela ämne upphettas till strax över 65 ° C (Vid BIO RAD maskin är närmare 90 ° C ) Vid denna temperatur bryts vätebindningar mellan nukleotiderna i DNA för. Och det är ingen risk för skada på nukleotider sedan de först smälter vid + 300 ° C
· Steg 3: Ämnet åter kylas till under 65 ° C Där den fria nukleotider har åtagit sig att platserna i DNA, och på detta sätt nu med två identiska DNA-strängar, kan denna sekvens ske igen och varje gång fördubblas antalet DNA-bitar.
Färgen markör jag nämnde i teorin avsnittet om elektrofores, som måste säga ange hur långt DNA-bitar nås i gelen, skulle de vill inte gå helt igenom. Detta innebär att bitar av markören är mindre än den minsta bitar av DNA. Men det även finns sådant i våra experiment, så markören har en hastighet på 500bp motsvarar en sekvens av 500 baspar. Höjdpunkterna i denna markör gör kommer att vara synlig för blotta ögat, så att så skrev då att stänga av.
TAE buffert (Tri-acetat-x) roll är att hålla DNA stabilt vid pH 7,6. Detta måste göras eftersom ett pH-värde på 7,6 gör att DNA är negativt laddade. Bilden till höger visar AMP adenosinmonofosfat, en nukleotid och en kan se de negativa slut med O -.
· Storlek markör:
I denna studie är det viktigt att jämföra storleken på utskärningar DNA, så att ha en referens med hjälp av en så kallad storlek markör, som i detta fall är en DNA-storlek markör. Det DNA som vi använde kom från ett virus och vi måste anta att det är ett virus som forskarna har fastställt hela sin arvsmassa, och därmed alla bas-sekvenser. Så när vi vet storleken på alla fragment, som mäter hur långt de har vandrat i gelen kan vi göra ett diagram i en Semi-koordinater. Detta visar hur många baspar upp den andra axeln och antal vandrade mm. i gelen ur den första axel. Resultaten framgår i avsnittet "Resultat".
Metod
se Motion Guide.
Felkällor
Under experimentet kom vi till hälla TAE buffert ner röret så småningom. Av denna anledning våra DNA-prover lite suddig. Men detta inte påverkade resultatet, som i slutändan var det bästa, jämfört med de andra grupperna. Ett fel är det, men kanske en gynnsam en i sitt slag.
Annan möjlig källa till fel, men inte dokumenterats, kan det vara att gelen är inte helt homogena men koncentrationen av sackaros kan bara en bråkdel högre i vissa områden av gelen, kan detta leda sedan till variationer i resandet.
Resultat
Jag har valt att använda tillverkarens (Bio-Rad) bild av gelen, eftersom detta ger den mest korrekta resultat.
1: Storlek markör
2: Salten 1
3: Salten 2
4: Polen
5: Ukraina
6: Grekland
7: Serbien
Här är resultaten från regressionen av vår virus-DNA:
Den blå linjen som sett exponentiell regression, och den funktion du får ut av det ritas med tunna streckade linjen.
Jag gjorde då en regel så att du kan beräkna antalet baspar från antalet migrerat mm. Jag har dock valt att utesluta den första punkten med 23.130 baspar, eftersom den skiljer sig från den i övrigt raka linjer i semi-koordinater, men med de övriga resultaten är regeln att se ut så här:
Om f (x) Antalet baspar, och x är antalet migreras mm. Från denna modell och den uppmätta avstånd från gelen kan du köra en tabell där de olika paren bandet bas för de olika sköldpaddor DNA:
Salten 1
Salten 2
Polen
Ukraina
Grekland
Serbien
3648
2820
2970
3821
3189
2969
2969
1112
1773
3078
2620
2070
740
862
1117
740
1061
1116
Diskussion
Om man tittar på tabellen över sköldpaddor och deras bas storlekar par, kan du relativt enkelt avgöra att sköldpaddan "Salten 1 " utsatta och att det lämnats av den ukrainska underarter. Den största skillnaden i baspar mellan de två, är på 173 baspar. Man måste säga att det är relativt lite när 173 baspar nästan ingenting är, och vi fann att det fanns en osäkerhet markör runt. 100-200 baspar. När vi tittar på Salten 2 ser det genast värre. Den har ingen omedelbar likheter med någon av de andra. Detta är en stark indikation på att de stammar från den ursprungliga nordeuropeiska underarten, trots att de räknas som utdöd 2000 år sedan. Men du måste berätta resultatet försvar att om bara den befolkning som är liten nog, kommer det ha varit mycket svåra att upptäcka i naturen. Turtle övervintrar som jag sa i sju månader, och det finns annat här växtlighet runt sjöar och vattendrag är delvis borta, så att man kunde lätt se den. Det bör också sägas att det är ett nattdjur, och hon kommer att känna till någorlunda hotad, glider det tyst och stilla i vattnet.
Ett annat faktum som du kan se från gelen, är att de alla är mycket nära besläktade, men vi visste detta i förväg, men det är tydligt framgår av tabellen i det att de alla har en DNA-sekvens ca 3000 baspar. Närmare bestämt är det genomsnittet av de banden på 3016, och den största avvikelsen från detta är Grekland med 173 baspar, och återigen detta inom den osäkerhet om markören.
Vi först fick höra om att "... om sommarens varmaste månaden genomsnittliga temperaturen ligger under 18 °, ägg göra sitt inte luckan" Detta faktum har jag granskat och betraktas från DMI: s hemsida en skildring av Midtjyllands klimat från 1961 till 1990:
Och som framgår av mörk linje som visar medeltemperaturen har gennemsnitstemperatu-ren i de varmaste månaderna (juli till ett genomsnitt på 15,4 ° C) var inte i närheten av krävs 18 ° C, så det ger ett dilemma. Antingen måste vi helt förkasta våra resultat, som annars starkt tyder på att de har sitt ursprung från den ursprungliga danska underart, eller kan välja att ignorera det faktum att i ett antal år till 29 år har det skett en temperatur på 18 ° C.
Om våra restriktionsenzym inte hade fungerat vår gel skulle ha gett oss en mycket dålig bild att arbeta med, eftersom tanke på att det skulle skäras någonstans i DNA, skulle det bli en mycket lång bas-sekvens som skulle gå mycket något i gelen, eftersom agarosemængden anpassat sig mycket små bitar. Därför skulle vi bara se en stor linje rakt ut i bäcken, och vi skulle inte kunna använda detta resultat till något.
Slutsats
Nu när jag har kommit fram till att jag skulle ha ett definitivt svar. Detta är bara inte sant. Jag har två motstridiga argument: Om du väljer bara att titta på gelen, jag tycker att träsk havssköldpadda Salten 1 är en utsatt "fattiga", eftersom sammansättningen av DNA-sekvenser påminner träffa en hel del om den från Ukraina, som också finns att köpa på danska djur återförsäljare. Och Salten 2 är en efterlevande underart, som har bott i semi-gömmer sig i 2000 år.
Om du väljer dock att även titta på grafen från DMI, ser vi här det motsägelsefulla argument. Det har under perioden 1961-1990 fanns ingen i juli med en medeltemperatur av de nödvändiga 18 °. Detta visar att det inte är en överlevare och barnafödande befolkningen, eftersom det helt enkelt inte skulle ha en månad som är varm nog att kläcka sina ägg.
Jag vill dock säga att om denna rättegång att lyckas måste vi kasta argumentet med de nödvändiga 18 °, eftersom detta helt förstör annars fina resultat, att det finns en efterlevande vild träsk sköldpadda i Danmark. Eller ska vi slå på den och hitta en lösning på detta problem. Och en möjlig teoretisk lösning på problemet kan vara att sköldpaddan har utsatts för ett selektivt tryck som skulle straffa den förmågan att lägga ägg som kan kläckas vid lägre temperaturer, så att det helt enkelt har skett en utveckling i förhållande till sötvattenssköldpaddan i södra Europa. Detta skulle ge mycket sunt förnuft.
Det har siktats europeiska sötvattenssköldpaddor (Emys orbicularis) i Danmark, former Salten Å (vi tittar på två här) och Igelsø. Frågan är, kommer varifrån detta? Vi var lastad med två teorier, men en tredjedel finns:
1. En naturlig lärarens tro på att översvämma sköldpadda har överlevt i centrala Jylland, och är inte utrotad 2000 år sedan, som vi trott. De var efter hans vittnesmål inför en liten population av den ursprungliga danska (North European) underarter. Denna överlevnad var åstadkommas utan äkta beskrivs observationer.
2. Att det är inköpt PET är antingen lägga ut ett par kopior, eller att de systematiskt har distribuerats från släktet skulle då dessa från Balkan, Serbien och Ukraina, eftersom det är dessa du kan köpa i djuraffärer.
3. En tredje teori, som vi inte får direkt ut är det att det är en ny underart eller ras de utsatta grupperna i de år som borde ha lagt djur ut (som inte kan vara mer än 100 år, om alls) bör ha evolution till en sub-ras. Detta skulle endast ske om den enskilde muterade, detta är troligt, men sannolikheten uppges vara så liten att denna teori lätt kan avskedas.
Man kan säga mycket om den första teorin, om jag måste göra en kommentar, skulle jag genast kalla det pop-biologi, denna teori locka mycket media intresse, men inte direkt av de stora i sig. Sedan dess har naturen som vi ställs inför kommer inte med några konkreta bevis, utan bara en massa indicier och postulat. Däremot kan man säga att det varit allmänt accepterat, t.ex. kan för nämnas att i en annars mycket informativ online lexikon som Wikipedia, läser vi: "Europeiska damm sköldpadda (Emys orbicularis) återupptäcktes i Danmark, Midtjylland i 1997. " Här måste man säga att de visar att det inte bara är ett fåtal som utsätts exemplar, men en verklig population.
Vårt syfte med detta arbete är att bestämma var dessa sköldpaddor observerats verkligen från. Vi har DNA från Salten Å, Polen, Ukraina, Grekland och Serbien. Om deras DNA matcher med de som kommer från Balkan, måste vi dra slutsatsen att de är utsatta, medan de är annorlunda, kan man säga att de är bevarade kopior av 2000 år gamla Midtjyske underarter.
Teori
Det finns vissa teoretiska ämnen som måste vara här, så jag valde att dela upp det i dessa fyra underteman:
· Europeiska damm sköldpadda:
Den europeiska damm sköldpadda, orbicularis är Emys en sköldpadda som finns i södra och centrala Europa, västra Asien och norra Afrika, men eftersom detta har en sådan utbredd områden beskriver ofta EU som en undeart namngiven Emys orbicularis orbicularis att skilja mellan den och annan också utbredd underart Emys orbicularis orientalis.
Den lever i långsamt rinnande vatten, och övervintra i upp till sju månader. Det är ägg, som många andra reptiler och att de ska kunna kläckas, den varmaste sommaren månadens medeltemperatur överstiger 18 ° C .
· Elektrofores och enzymer begränsning:
En elektrofores är en typ av rening av DNA-bitar. Men innan vi kan gå vidare med elektrofores, bör du har klippt sitt DNA i bitar. För den här användaren mån restriktionsenzymer som är speciellt avsedd för att såga efter en speciell kod. De enzymer vi använde heter ECO R1 och R1 PST, och dessa klippor, respektive av G Eftf. av AATTC och CTGCA Eftf. på G, detta ser ut så här:
När du har klippt DNA i mindre bitar tillägga, en tung markör buffert så att senare i försöket kan se hur mycket DNA-bar är horisontell.
Gelen, som kallas sikten är gjord av agaros, avjoniserat vatten och gel buffert. Agarose är som namnet antyder ett socker (kolhydrater), extraherade från japanska röda alger. Volymen av agarosen avgör hur nära filtret är, du har små sekvenser av DNA vill ha en tät filter, och du lägger därför mycket agaros. När vi tillverkade den upplöstes vi 0,5 gram agaros i 50 ml TAE buffert (se nedan) och värm i mikrovågsugn så att de två ämnena smälte samman. Häll därefter fortfarande flytande gel i badkaret där den stelnar.
När man har ägnat sitt DNA i gelen uppsättningar mån flödet i varje ände av badet. I ena änden är anod (positiva elektroden) och den andra är katoden (negativa elektroden). Det har vänt den gelen så att utgången tilldelades mix i att vända sig bort från anoden. Detta beror på att DNA-molekyler är negativt laddade, så de kommer att gå över till anoden. Resa genom gelen äger rum vid olika hastigheter beroende på molekyl storlek. De större molekylerna långsammare de rör sig genom gelen. Anledningen till att vi har lagt markørbufferen är att det alltid kommer att gå fortare än vissa av de DNA-molekyler, så när markören har kommit ner till den andra änden av Mon strömmen.
· PCR, färg markör och TAE buffert:
En kritisk problem i denna studie är den mängd av DNA för att göra en ordentlig elektrofores, vilket ger en realistisk bild, du måste ha mycket DNA-material. Om du inte kan du använda en molekylärbiologisk reproduktion metod som kallas för PCR, Polymerase Chain Reaction (PCR), som uppfanns redan 1983 av Kary Mullis, som 10 år senare fick Nobels kemi priset för just denna upptäckt. Som namnet antyder är det ett artificiellt producerade replikationsmetode. Det är relativt enkelt, har jag försökt att illustrera det i figuren nedan:
· Steg 1: DNA hälls i en behållare tillsammans med polymeras och fria nukleotider.
· Steg 2: Hela ämne upphettas till strax över 65 ° C (Vid BIO RAD maskin är närmare 90 ° C ) Vid denna temperatur bryts vätebindningar mellan nukleotiderna i DNA för. Och det är ingen risk för skada på nukleotider sedan de först smälter vid + 300 ° C
· Steg 3: Ämnet åter kylas till under 65 ° C Där den fria nukleotider har åtagit sig att platserna i DNA, och på detta sätt nu med två identiska DNA-strängar, kan denna sekvens ske igen och varje gång fördubblas antalet DNA-bitar.
Färgen markör jag nämnde i teorin avsnittet om elektrofores, som måste säga ange hur långt DNA-bitar nås i gelen, skulle de vill inte gå helt igenom. Detta innebär att bitar av markören är mindre än den minsta bitar av DNA. Men det även finns sådant i våra experiment, så markören har en hastighet på 500bp motsvarar en sekvens av 500 baspar. Höjdpunkterna i denna markör gör kommer att vara synlig för blotta ögat, så att så skrev då att stänga av.
TAE buffert (Tri-acetat-x) roll är att hålla DNA stabilt vid pH 7,6. Detta måste göras eftersom ett pH-värde på 7,6 gör att DNA är negativt laddade. Bilden till höger visar AMP adenosinmonofosfat, en nukleotid och en kan se de negativa slut med O -.
· Storlek markör:
I denna studie är det viktigt att jämföra storleken på utskärningar DNA, så att ha en referens med hjälp av en så kallad storlek markör, som i detta fall är en DNA-storlek markör. Det DNA som vi använde kom från ett virus och vi måste anta att det är ett virus som forskarna har fastställt hela sin arvsmassa, och därmed alla bas-sekvenser. Så när vi vet storleken på alla fragment, som mäter hur långt de har vandrat i gelen kan vi göra ett diagram i en Semi-koordinater. Detta visar hur många baspar upp den andra axeln och antal vandrade mm. i gelen ur den första axel. Resultaten framgår i avsnittet "Resultat".
Metod
se Motion Guide.
Felkällor
Under experimentet kom vi till hälla TAE buffert ner röret så småningom. Av denna anledning våra DNA-prover lite suddig. Men detta inte påverkade resultatet, som i slutändan var det bästa, jämfört med de andra grupperna. Ett fel är det, men kanske en gynnsam en i sitt slag.
Annan möjlig källa till fel, men inte dokumenterats, kan det vara att gelen är inte helt homogena men koncentrationen av sackaros kan bara en bråkdel högre i vissa områden av gelen, kan detta leda sedan till variationer i resandet.
Resultat
Jag har valt att använda tillverkarens (Bio-Rad) bild av gelen, eftersom detta ger den mest korrekta resultat.
1: Storlek markör
2: Salten 1
3: Salten 2
4: Polen
5: Ukraina
6: Grekland
7: Serbien
Här är resultaten från regressionen av vår virus-DNA:
Den blå linjen som sett exponentiell regression, och den funktion du får ut av det ritas med tunna streckade linjen.
Jag gjorde då en regel så att du kan beräkna antalet baspar från antalet migrerat mm. Jag har dock valt att utesluta den första punkten med 23.130 baspar, eftersom den skiljer sig från den i övrigt raka linjer i semi-koordinater, men med de övriga resultaten är regeln att se ut så här:
Om f (x) Antalet baspar, och x är antalet migreras mm. Från denna modell och den uppmätta avstånd från gelen kan du köra en tabell där de olika paren bandet bas för de olika sköldpaddor DNA:
Salten 1
Salten 2
Polen
Ukraina
Grekland
Serbien
3648
2820
2970
3821
3189
2969
2969
1112
1773
3078
2620
2070
740
862
1117
740
1061
1116
Diskussion
Om man tittar på tabellen över sköldpaddor och deras bas storlekar par, kan du relativt enkelt avgöra att sköldpaddan "Salten 1 " utsatta och att det lämnats av den ukrainska underarter. Den största skillnaden i baspar mellan de två, är på 173 baspar. Man måste säga att det är relativt lite när 173 baspar nästan ingenting är, och vi fann att det fanns en osäkerhet markör runt. 100-200 baspar. När vi tittar på Salten 2 ser det genast värre. Den har ingen omedelbar likheter med någon av de andra. Detta är en stark indikation på att de stammar från den ursprungliga nordeuropeiska underarten, trots att de räknas som utdöd 2000 år sedan. Men du måste berätta resultatet försvar att om bara den befolkning som är liten nog, kommer det ha varit mycket svåra att upptäcka i naturen. Turtle övervintrar som jag sa i sju månader, och det finns annat här växtlighet runt sjöar och vattendrag är delvis borta, så att man kunde lätt se den. Det bör också sägas att det är ett nattdjur, och hon kommer att känna till någorlunda hotad, glider det tyst och stilla i vattnet.
Ett annat faktum som du kan se från gelen, är att de alla är mycket nära besläktade, men vi visste detta i förväg, men det är tydligt framgår av tabellen i det att de alla har en DNA-sekvens ca 3000 baspar. Närmare bestämt är det genomsnittet av de banden på 3016, och den största avvikelsen från detta är Grekland med 173 baspar, och återigen detta inom den osäkerhet om markören.
Vi först fick höra om att "... om sommarens varmaste månaden genomsnittliga temperaturen ligger under 18 °, ägg göra sitt inte luckan" Detta faktum har jag granskat och betraktas från DMI: s hemsida en skildring av Midtjyllands klimat från 1961 till 1990:
Och som framgår av mörk linje som visar medeltemperaturen har gennemsnitstemperatu-ren i de varmaste månaderna (juli till ett genomsnitt på 15,4 ° C) var inte i närheten av krävs 18 ° C, så det ger ett dilemma. Antingen måste vi helt förkasta våra resultat, som annars starkt tyder på att de har sitt ursprung från den ursprungliga danska underart, eller kan välja att ignorera det faktum att i ett antal år till 29 år har det skett en temperatur på 18 ° C.
Om våra restriktionsenzym inte hade fungerat vår gel skulle ha gett oss en mycket dålig bild att arbeta med, eftersom tanke på att det skulle skäras någonstans i DNA, skulle det bli en mycket lång bas-sekvens som skulle gå mycket något i gelen, eftersom agarosemængden anpassat sig mycket små bitar. Därför skulle vi bara se en stor linje rakt ut i bäcken, och vi skulle inte kunna använda detta resultat till något.
Slutsats
Nu när jag har kommit fram till att jag skulle ha ett definitivt svar. Detta är bara inte sant. Jag har två motstridiga argument: Om du väljer bara att titta på gelen, jag tycker att träsk havssköldpadda Salten 1 är en utsatt "fattiga", eftersom sammansättningen av DNA-sekvenser påminner träffa en hel del om den från Ukraina, som också finns att köpa på danska djur återförsäljare. Och Salten 2 är en efterlevande underart, som har bott i semi-gömmer sig i 2000 år.
Om du väljer dock att även titta på grafen från DMI, ser vi här det motsägelsefulla argument. Det har under perioden 1961-1990 fanns ingen i juli med en medeltemperatur av de nödvändiga 18 °. Detta visar att det inte är en överlevare och barnafödande befolkningen, eftersom det helt enkelt inte skulle ha en månad som är varm nog att kläcka sina ägg.
Jag vill dock säga att om denna rättegång att lyckas måste vi kasta argumentet med de nödvändiga 18 °, eftersom detta helt förstör annars fina resultat, att det finns en efterlevande vild träsk sköldpadda i Danmark. Eller ska vi slå på den och hitta en lösning på detta problem. Och en möjlig teoretisk lösning på problemet kan vara att sköldpaddan har utsatts för ett selektivt tryck som skulle straffa den förmågan att lägga ägg som kan kläckas vid lägre temperaturer, så att det helt enkelt har skett en utveckling i förhållande till sötvattenssköldpaddan i södra Europa. Detta skulle ge mycket sunt förnuft.
Abonner på:
Opslag (Atom)